La transformación de la Base de Datos SIDIAP a un modelo común del OMOP ayuda a la investigación sobre la COVID-19
El artículo “Transforming the Information System for Research in Primary Care (SIDIAP) in Catalonia to the OMOP Common Data Model and Its Use for COVID-19 Research” ha sido publicado en la revista Clinical Epidemiology y describe la estandarización de la base de datos de atención primaria SIDIAP al modelo común de datos Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP).
El artículo describe el proceso de estandarización que se ha llevado a cabo para transformar la base de datos SIDIAP en el modelo común de datos OMOP, así como el control de calidad realizado para garantizar la idoneidad de la base de datos para la investigación . Además, el artículo ofrece una ilustración práctica del uso de la base de datos SIDIAP-OMOP en la investigación relacionada con la COVID-19, ofreciendo una descripción del número y las características de más de 600.000 personas afectadas por la infección en Cataluña hasta junio de 2022. Esta descripción incluye los casos atendidos en la atención primaria, así como los casos que requirieron hospitalización o ingreso en unidades de cuidados intensivos (UCI), y las defunciones asociadas a la COVID-19 . Además, el artículo describe las características de más de 4,5 millones de personas vacunadas contra la COVID-19.
A día de hoy, la implementación de OMOP ha proporcionado a nuestros investigadores e investigadoras la oportunidad de participar en más de 15 publicaciones de estudios internacionales sobre la COVID-19, dado que facilita la colaboración con entidades con acceso a otras bases de datos que ya han transformado sus datos en este modelo estándar. La implementación de este modelo común de datos nos permite liderar y participar en estudios en los que se analizan diferentes bases de datos de forma federada, compartiendo exclusivamente los códigos analíticos, sin necesidad de compartir datos a nivel individual. Este enfoque supone una mejora significativa en la transparencia y la capacidad de reproducir los resultados de la investigación. Además, permite el uso de herramientas analíticas estandarizadas, que facilitan los análisis y que pueden utilizarse en cualquier base de datos que haya implementado este estándar. A pesar de este estudio ejemplifica el uso de la base de datos para la investigación sobre la COVID-19, la base de datos SIDIAP-OMOP se puede utilizar para responder a preguntas de investigación en otros ámbitos.
La transformación de SIDIAP a OMOP ha sido implementada por parte del equipo del SIDIAP en colaboración con el grupo de investigación Real World Epidemiology del IDIAP Jordi Gol, liderado por la investigadora Talita Duarte Salles, y ha contado con el apoyo y la financiación de la European Health Data and Evidence Network (EHDEN) y de la Generalitat de Catalunya.
