Las Unidades de soporte territorial (USR) permiten al IDIAPJGol gestionar, asesorar y organizar las iniciativas de investigación que puedan surgir en el territorio. Las USR aproximan los servicios del IDIAPJGol a los investigadores, ayudándoles en el desarrollo de sus proyectos, les informa sobre ayudas y convocatorias existentes, les facilita los trámites de solicitud y la gestión del presupuesto recibido, y les apoya para su ejecución.

El IDIAPJGol se organiza territorialmente en 8 Unidades de Apoyo a la Investigación: Barcelona, ​​Cataluña Central, Girona, Lleida-Pirineos, Metropolitana Norte, Costa de Poniente, Tarragona y Terres de l’Ebre.